29 lipca 1656 roku na terenie naszej Parafii miała miejsce szarża 2 rot husarii litewskiej na wojska szwedzkie w czasie bitwy o Warszawę w czasie „potopu szwedzkiego”.
W czerwcu 1993 roku Kuria Warszawsko-Praska skierowała ks. Ryszarda Ladzińskiego do organizowania nowego ośrodka duszpasterskiego na warszawskim Bródnie.
26 października 1993 roku ks. Proboszcz wspólnie z ks. Biskupem Ordynariuszem dokonali ustaleń co do wezwania, pod jakim powstanie nowa parafia.
W czerwcu 1994 roku uzyskano od gminy Praga-Północ zgodę na lokalizację dla inwestycji dotyczącej budowy ośrodka duszpasterskiego.
23 czerwca 1994 roku ks. Biskup Stanisław Kędziora poświęcił krzyż i plac oraz przewodniczył pierwszej Mszy Św. Od tego dnia odprawiano codziennie Msze Św. na placu gromadząc licznych wiernych tworzących początek wspólnoty. W tym czasie na miejscu obecnego kościoła powstawała drewniana kaplica.
1 października 1994 roku budowa kaplicy została ukończona, a 5 października tego roku ks. Biskup Kazimierz Romaniuk odprawił w niej Mszę Św. Był to dzień patronki naszej parafii – wtedy jeszcze błogosławionej Faustyny. Od tej pory zaczęło się normalne życie parafii, codziennie sprawowane były Msze św. rano i wieczorem, oraz nabożeństwa dyktowane kalendarzem liturgicznym.
1 stycznia 1995 roku ośrodek duszpasterski otrzymał prawa „Prawie Parafii”.
W lutym 1997 r. dekretem ks. biskupa ordynariusza Kazimierza Romaniuka erygowano Parafię Błogosławionej Faustyny w Warszawie przy ul. Żuromińskiej 2 z części parafii M.B. Różańcowej i Św. Wincentego a Paulo.
W 1995 roku rozpoczęliśmy budowę domu parafialnego – plebanii.
6 sierpnia 1998 roku parafia uzyskała zezwolenie na budowę kościoła, która rozpoczęła się 18 sierpnia tego roku. Architektami, którzy opracowali plany budowy domu parafialnego i kościoła, są panowie inżynierowie-architekci Andrzej Gniazdowski i Józef Marek. Kierownictwo nad budową objęli panowie inżynierowie Wiesław Dołęga i Jerzy Palmowski.
22 maja 1999 roku, podczas pierwszej wizytacji kanonicznej, został odczytany akt erekcyjny, który wraz z kamieniem węgielnym został wmurowany we wznoszące się fundamenty nowej świątyni.
W kwietniu 2000 roku, po kanonizacji błogosławionej Faustyny, parafia zmieniła tytuł. Od tego momentu nosi wezwanie Św. Faustyny.
Prace przy wznoszeniu świątyni trwały. Zbudowano mury, położono żelbetonowy strop, a następnie pokryto dach kościoła blachą miedzianą. Od tego momentu rozpoczęto prace wewnątrz kościoła: założono instalację elektryczną, gazową i wodną. Wykonano nagłośnienie kościoła, pomalowano ściany i w ten sposób kościół został przygotowany do wstępnego otwarcia.
25 grudnia 2003 roku ksiądz Biskup Kazimierz Romaniuk pobłogosławił kościół i sprawował w nim pasterkę – pierwszą Mszę Św. w nowym kościele. Od tej chwili wszystkie nabożeństwa są tu sprawowane, chociaż do jej ukończenia potrzeba było jeszcze wiele nakładów i wysiłku.
W lipcu i sierpniu 2005 roku wykonano ogrzewanie w posadzce kościoła i położono płyty granitowe, a we wrześniu zamontowano na wieży kościelnej trzy dzwony: Św. Faustyna, Maryja i Św. Jan Paweł II (odpowiednio: 500kg, 800 kg, 1500 kg), które poświęcił w czasie Mszy Św. odpustowej 5 października 2005 r. ks. Arcybiskup Sławoj Leszek Głódź.
O wystrój całego wnętrza wg wstępnego założenia zadbał pan architekt Janusz Sobczyk i jego pracownia Ars-Antiqva. Prace postępowały sukcesywnie. W latach 2009-2013 zostało wykonane prezbiterium, witraże, kaplica chrzcielna, ołtarze boczne: Jan Paweł II i Matka Boża Nieustającej Pomocy, Droga Krzyżowa, Zacheusze, Memoriał Katyńsko-Smoleński, kropielnice i tablica konsekracyjna.
Posadzka prezbiterium wykonana jest z włoskiego marmuru Breccia Sarda, na ścianach płyty trawertynowe Trawertino Romano, ołtarz i ambona a także chrzcielnica z włoskiego marmuru – Carrara Statuario z okolic Toskanii – ulubionego materiału Michała Anioła. Mozaika w głównym ołtarzu i w kaplicy chrztu z manufaktur weneckich.
Wszystkie elementy na posadzce i ścianach wraz z ołtarzem, amboną i chrzcielnicą, Drogą Krzyżową i tablicą konsekracyjną zostały wykonane przez firmy włoskie Fratelli Testi i Luciano Padovaniego koło Werony.
W sierpniu 2013 roku wnętrze kościoła zostało odnowione przez firmę malarską Maj Max.
6 października 2013 roku Ordynariusz Diecezji Ksiądz Biskup Henryk Hoser SAC podczas uroczystej Mszy Świętej o godz. 12.00 konsekrował świątynię.
W 2020 roku w czasie trwania pandemii dokonano przebudowy – zmiany fasady kościoła. Zamurowano okno i została umieszczona rozeta z witraże Jezusa Miłosiernego wraz ze św. Faustyną i św. Janem Pawłem II. Całość fasady została obłożona włoskim kamieniem, co nadało jej nowego kształtu.
27 kwietnia 2024 roku ks. Bartosz Adamczewski został administratorem Parafii św. Faustyny, a 26 grudnia 2025 roku – jej proboszczem. W tym czasie wykonano nowe nagłośnienie kościoła (firma Rduch) i nowe oświetlenie prezbiterium (firma Helicon).
